Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms