Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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