Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRGP23470 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms