Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CGGBP1Q9UFW8 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CGGBP1Q9UFW8 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CGGBP1Q9UFW8 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CGGBP1Q9UFW8 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CGGBP1Q9UFW8 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CGGBP1Q9UFW8 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CGGBP1Q9UFW8 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CGGBP1Q9UFW8 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CGGBP1Q9UFW8 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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