Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PCDH10Q9P2E7 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PCDH10Q9P2E7 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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PCDH10Q9P2E7 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PCDH10Q9P2E7 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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