Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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ZNF239Q16600 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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ZNF239Q16600 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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ZNF239Q16600 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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ZNF239Q16600 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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ZNF239Q16600 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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