Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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SGCBQ16585 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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