Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GABRA6Q16445 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GABRA6Q16445 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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