Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SCN9AQ15858 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SCN9AQ15858 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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