Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNA6Q15825 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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