Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
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