Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HMGN3Q15651 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HMGN3Q15651 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
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