Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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SYCP1Q15431 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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SYCP1Q15431 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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SYCP1Q15431 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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SYCP1Q15431 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SYCP1Q15431 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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