Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms