Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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