Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SP140Q13342 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SP140Q13342 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SP140Q13342 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SP140Q13342 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SP140Q13342 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SP140Q13342 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SP140Q13342 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SP140Q13342 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SP140Q13342 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
SP140Q13342 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SP140Q13342 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SP140Q13342 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SP140Q13342 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SP140Q13342 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms