Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms