Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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CHAF1BQ13112 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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CHAF1BQ13112 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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CHAF1BQ13112 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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CHAF1BQ13112 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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