Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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