Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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PTPRAP18433 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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PTPRAP18433 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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PTPRAP18433 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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