Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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