Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SPG7Q9UQ90 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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