Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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LRRIQ1Q96JM4 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LRRIQ1Q96JM4 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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LRRIQ1Q96JM4 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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LRRIQ1Q96JM4 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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