Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP6Q3SY56 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms