Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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