Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK5Q16478 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms