Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms