Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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E2F4Q16254 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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E2F4Q16254 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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E2F4Q16254 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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