Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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