Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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HERPUD1Q15011 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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HERPUD1Q15011 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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HERPUD1Q15011 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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