Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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