Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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UBE4AQ14139 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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UBE4AQ14139 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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UBE4AQ14139 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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UBE4AQ14139 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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UBE4AQ14139 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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UBE4AQ14139 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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UBE4AQ14139 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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