Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL9A2Q14055 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL9A2Q14055 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL9A2Q14055 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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