Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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