Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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