Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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