Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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