Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
XRCC4Q13426 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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