Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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ITGB3BPQ13352 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ITGB3BPQ13352 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ITGB3BPQ13352 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ITGB3BPQ13352 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ITGB3BPQ13352 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ITGB3BPQ13352 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ITGB3BPQ13352 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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ITGB3BPQ13352 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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ITGB3BPQ13352 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ITGB3BPQ13352 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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