Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms