Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TROQ12816 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TROQ12816 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TROQ12816 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TROQ12816 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TROQ12816 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TROQ12816 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TROQ12816 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TROQ12816 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TROQ12816 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TROQ12816 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TROQ12816 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TROQ12816 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms