Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms