Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms