Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHDQ96IW2 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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