Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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ZBED3Q96IU2 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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ZBED3Q96IU2 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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ZBED3Q96IU2 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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ZBED3Q96IU2 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
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ZBED3Q96IU2 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
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ZBED3Q96IU2 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZBED3Q96IU2 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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