Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
UBXN4Q92575 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms