Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00612Q8N6U2 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms