Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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