Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CFAP47Q6ZTR5 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms