Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Q1T7F1 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 RN7SL798P-201ENST00000468562 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 ZFAND1-214ENST00000521287 772 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Q1T7F1 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Q1T7F1 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Q1T7F1 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms